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Artigo de periodico
Combination of differential expression and co-expression network analyses identify novel conserved age-associated changes among different tissues (2023)
Batalha, Caio M. P. F; Fujita, André ; Souza-Pinto, Nadja Cristhina de
Fonte: bioRxiv. Unidades: IME, IQ
Assuntos: ENVELHECIMENTO, EXPRESSÃO GÊNICA
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ABNT
BATALHA, Caio M. P. F e FUJITA, André e SOUZA-PINTO, Nadja Cristhina de. Combination of differential expression and co-expression network analyses identify novel conserved age-associated changes among different tissues. bioRxiv, 2023Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1101/2023.05.26.542445. Acesso em: 05 maio 2024.
APA
Batalha, C. M. P. F., Fujita, A., & Souza-Pinto, N. C. de. (2023). Combination of differential expression and co-expression network analyses identify novel conserved age-associated changes among different tissues. bioRxiv. doi:10.1101/2023.05.26.542445
NLM
Batalha CMPF, Fujita A, Souza-Pinto NC de. Combination of differential expression and co-expression network analyses identify novel conserved age-associated changes among different tissues [Internet]. bioRxiv. 2023 ;[citado 2024 maio 05 ] Available from: https://doi.org/10.1101/2023.05.26.542445
Vancouver
Batalha CMPF, Fujita A, Souza-Pinto NC de. Combination of differential expression and co-expression network analyses identify novel conserved age-associated changes among different tissues [Internet]. bioRxiv. 2023 ;[citado 2024 maio 05 ] Available from: https://doi.org/10.1101/2023.05.26.542445
Artigo de periodico
Annotation and functional characterization of long noncoding RNAs deregulated in pancreatic adenocarcinoma (2022)
Paixão, Vinicius Ferreira da ; Sosa, Omar Júlio ; Pellegrina, Diogo Vieira da Silva; Dazzani, Bianca; Corrêa, Thalita Bueno; Bertoldi, Ester Risério Matos; Moraes, Luís Bruno da Cruz e Alves de; Pessoa, Diogo de Oliveira ; Oliveira, Victoria de Paiva; Zevallos, Ricardo Alberto Chiong; Russo, Lilian Cristina ; Forti, Fabio Luis ; Ferreira, João Eduardo ; Freitas, Helano Carioca; Jukemura, José ; Machado, Marcel Cerqueira Cesar ; Begnami, María Dirlei; Setubal, João Carlos ; Bassères, Daniela Sanchez ; Reis, Eduardo Moraes
Fonte: Cellular Oncology. Unidades: IQ, IME, FM, BIOINFORMÁTICA
Assuntos: RNA, ADENOCARCINOMA
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ABNT
PAIXÃO, Vinicius Ferreira da et al. Annotation and functional characterization of long noncoding RNAs deregulated in pancreatic adenocarcinoma. Cellular Oncology, v. 45, n. 3, p. 479-504, 2022Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1007/s13402-022-00678-5. Acesso em: 05 maio 2024.
APA
Paixão, V. F. da, Sosa, O. J., Pellegrina, D. V. da S., Dazzani, B., Corrêa, T. B., Bertoldi, E. R. M., et al. (2022). Annotation and functional characterization of long noncoding RNAs deregulated in pancreatic adenocarcinoma. Cellular Oncology, 45( 3), 479-504. doi:10.1007/s13402-022-00678-5
NLM
Paixão VF da, Sosa OJ, Pellegrina DV da S, Dazzani B, Corrêa TB, Bertoldi ERM, Moraes LB da C e A de, Pessoa D de O, Oliveira V de P, Zevallos RAC, Russo LC, Forti FL, Ferreira JE, Freitas HC, Jukemura J, Machado MCC, Begnami MD, Setubal JC, Bassères DS, Reis EM. Annotation and functional characterization of long noncoding RNAs deregulated in pancreatic adenocarcinoma [Internet]. Cellular Oncology. 2022 ; 45( 3): 479-504.[citado 2024 maio 05 ] Available from: https://doi.org/10.1007/s13402-022-00678-5
Vancouver
Paixão VF da, Sosa OJ, Pellegrina DV da S, Dazzani B, Corrêa TB, Bertoldi ERM, Moraes LB da C e A de, Pessoa D de O, Oliveira V de P, Zevallos RAC, Russo LC, Forti FL, Ferreira JE, Freitas HC, Jukemura J, Machado MCC, Begnami MD, Setubal JC, Bassères DS, Reis EM. Annotation and functional characterization of long noncoding RNAs deregulated in pancreatic adenocarcinoma [Internet]. Cellular Oncology. 2022 ; 45( 3): 479-504.[citado 2024 maio 05 ] Available from: https://doi.org/10.1007/s13402-022-00678-5
Trabalho de evento-resumo
LACEN: an R package for lncRNA functional annotation using co-expression networks (2022)
Sanches, Leonardo ; Pato, Gabriel Torres Gomes; Pellegrina, Diogo Vieira da Silva ; Ferreira, João Eduardo ; Reis, Eduardo Moraes
Fonte: Abstract Book. Nome do evento: Annual Meeting of the Brazilian Society for Biochemistry and Molecular Biology/SBBq. Unidades: IME, IQ, BIOINFORMÁTICA
Assuntos: RNA, NEOPLASIAS
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ABNT
SANCHES, Leonardo et al. LACEN: an R package for lncRNA functional annotation using co-expression networks. 2022, Anais.. São Paulo: Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular, 2022. Disponível em: https://www2.sbbq.org.br/reuniao/2022/images/livro_completo.pdf. Acesso em: 05 maio 2024.
APA
Sanches, L., Pato, G. T. G., Pellegrina, D. V. da S., Ferreira, J. E., & Reis, E. M. (2022). LACEN: an R package for lncRNA functional annotation using co-expression networks. In Abstract Book. São Paulo: Sociedade Brasileira de Bioquímica e Biologia Molecular. Recuperado de https://www2.sbbq.org.br/reuniao/2022/images/livro_completo.pdf
NLM
Sanches L, Pato GTG, Pellegrina DV da S, Ferreira JE, Reis EM. LACEN: an R package for lncRNA functional annotation using co-expression networks [Internet]. Abstract Book. 2022 ;[citado 2024 maio 05 ] Available from: https://www2.sbbq.org.br/reuniao/2022/images/livro_completo.pdf
Vancouver
Sanches L, Pato GTG, Pellegrina DV da S, Ferreira JE, Reis EM. LACEN: an R package for lncRNA functional annotation using co-expression networks [Internet]. Abstract Book. 2022 ;[citado 2024 maio 05 ] Available from: https://www2.sbbq.org.br/reuniao/2022/images/livro_completo.pdf
Artigo de periodico
Algal-derived halogenated Sesquiterpenes from Laurencia dendroidea as lead compounds in schistosomiasis environmental control (2022)
Santos, Guilherme Senna dos; Miyasato, Patricia Aoki; Stein, Erika Mattos ; Colepicolo, Pio ; Wright, Anthony D; Pereira, Carlos Alberto de Bragança ; Falkenberg, Miriam; Nakano, Eliana
Fonte: Marine Drugs. Unidades: BIOTECNOLOGIA, IQ, IME
Assuntos: SESQUITERPENOS, ALGAS, CHUMBO, ESQUISTOSSOMOSE, PRODUTOS NATURAIS, TERPENOS, SCHISTOSOMA MANSONI, LARVICIDAS
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ABNT
SANTOS, Guilherme Senna dos et al. Algal-derived halogenated Sesquiterpenes from Laurencia dendroidea as lead compounds in schistosomiasis environmental control. Marine Drugs, v. 20, p. 1-10 art. 111, 2022Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.3390/md20020111. Acesso em: 05 maio 2024.
APA
Santos, G. S. dos, Miyasato, P. A., Stein, E. M., Colepicolo, P., Wright, A. D., Pereira, C. A. de B., et al. (2022). Algal-derived halogenated Sesquiterpenes from Laurencia dendroidea as lead compounds in schistosomiasis environmental control. Marine Drugs, 20, 1-10 art. 111. doi:10.3390/md20020111
NLM
Santos GS dos, Miyasato PA, Stein EM, Colepicolo P, Wright AD, Pereira CA de B, Falkenberg M, Nakano E. Algal-derived halogenated Sesquiterpenes from Laurencia dendroidea as lead compounds in schistosomiasis environmental control [Internet]. Marine Drugs. 2022 ; 20 1-10 art. 111.[citado 2024 maio 05 ] Available from: https://doi.org/10.3390/md20020111
Vancouver
Santos GS dos, Miyasato PA, Stein EM, Colepicolo P, Wright AD, Pereira CA de B, Falkenberg M, Nakano E. Algal-derived halogenated Sesquiterpenes from Laurencia dendroidea as lead compounds in schistosomiasis environmental control [Internet]. Marine Drugs. 2022 ; 20 1-10 art. 111.[citado 2024 maio 05 ] Available from: https://doi.org/10.3390/md20020111
Artigo de periodico
TSSFinder—fast and accurate ab initio prediction of the core promoter in eukaryotic genomes (2021)
Oliveira, Mauro de Medeiros ; Bonadio, Ígor ; Melo, Alícia Lie de ; Souza, Gláucia Mendes ; Durham, Alan Mitchell
Fonte: Briefings in Bioinformatics. Unidades: IQ, IME, BIOINFORMÁTICA
Assuntos: TRANSCRIÇÃO GÊNICA, BIOINFORMÁTICA
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ABNT
OLIVEIRA, Mauro de Medeiros et al. TSSFinder—fast and accurate ab initio prediction of the core promoter in eukaryotic genomes. Briefings in Bioinformatics, v. 22, n. 6, p. 1-12, 2021Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1093/bib/bbab198. Acesso em: 05 maio 2024.
APA
Oliveira, M. de M., Bonadio, Í., Melo, A. L. de, Souza, G. M., & Durham, A. M. (2021). TSSFinder—fast and accurate ab initio prediction of the core promoter in eukaryotic genomes. Briefings in Bioinformatics, 22( 6), 1-12. doi:10.1093/bib/bbab198
NLM
Oliveira M de M, Bonadio Í, Melo AL de, Souza GM, Durham AM. TSSFinder—fast and accurate ab initio prediction of the core promoter in eukaryotic genomes [Internet]. Briefings in Bioinformatics. 2021 ; 22( 6): 1-12.[citado 2024 maio 05 ] Available from: https://doi.org/10.1093/bib/bbab198
Vancouver
Oliveira M de M, Bonadio Í, Melo AL de, Souza GM, Durham AM. TSSFinder—fast and accurate ab initio prediction of the core promoter in eukaryotic genomes [Internet]. Briefings in Bioinformatics. 2021 ; 22( 6): 1-12.[citado 2024 maio 05 ] Available from: https://doi.org/10.1093/bib/bbab198
Artigo de periodico
Synchronous down-modulation of miR-17 family members is an early causative event in the retinal angiogenic switch (2015)
Nunes, Diana N.; Dias-Neto, Emmanuel; Cardó-Vila, Marina; Edwards, Julianna K.; Dobroff, Andrey S.; Giordano, Ricardo José ; Mandelin, Jami; Brentani, Helena P.; Hasselgren, Catrin; Yao, Virginia J.; Marchiò, Serena; Pereira, Carlos Alberto de Bragança ; Passetti, Fabio; Calin, George A.; Sidman, Richard L.; Arap, Wadih; Pasqualini, Renata
Fonte: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Unidades: FM, IQ, IME
Assuntos: RNA MENSAGEIRO, RETINA (FISIOPATOLOGIA), RATOS, NEOVASCULARIZAÇÃO RETINIANA
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ABNT
NUNES, Diana N. et al. Synchronous down-modulation of miR-17 family members is an early causative event in the retinal angiogenic switch. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, v. 112, n. 12, p. 3770-3775, 2015Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1073/pnas.1500008112. Acesso em: 05 maio 2024.
APA
Nunes, D. N., Dias-Neto, E., Cardó-Vila, M., Edwards, J. K., Dobroff, A. S., Giordano, R. J., et al. (2015). Synchronous down-modulation of miR-17 family members is an early causative event in the retinal angiogenic switch. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 112( 12), 3770-3775. doi:10.1073/pnas.1500008112
NLM
Nunes DN, Dias-Neto E, Cardó-Vila M, Edwards JK, Dobroff AS, Giordano RJ, Mandelin J, Brentani HP, Hasselgren C, Yao VJ, Marchiò S, Pereira CA de B, Passetti F, Calin GA, Sidman RL, Arap W, Pasqualini R. Synchronous down-modulation of miR-17 family members is an early causative event in the retinal angiogenic switch [Internet]. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 2015 ; 112( 12): 3770-3775.[citado 2024 maio 05 ] Available from: https://doi.org/10.1073/pnas.1500008112
Vancouver
Nunes DN, Dias-Neto E, Cardó-Vila M, Edwards JK, Dobroff AS, Giordano RJ, Mandelin J, Brentani HP, Hasselgren C, Yao VJ, Marchiò S, Pereira CA de B, Passetti F, Calin GA, Sidman RL, Arap W, Pasqualini R. Synchronous down-modulation of miR-17 family members is an early causative event in the retinal angiogenic switch [Internet]. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 2015 ; 112( 12): 3770-3775.[citado 2024 maio 05 ] Available from: https://doi.org/10.1073/pnas.1500008112
Artigo de periodico
RECK is not an independent prognostic marker for breast cancer (2015)
Gomes, Luciana Rodrigues; Fujita, André ; Mott, Joni D ; Soares, Fernando Augusto ; Labriola, Leticia ; Sogayar, Mari Cleide
Fonte: BMC Cancer. Unidades: IME, FO, IQ
Assuntos: IMUNOHISTOQUÍMICA, NEOPLASIAS MAMÁRIAS
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ABNT
GOMES, Luciana Rodrigues et al. RECK is not an independent prognostic marker for breast cancer. BMC Cancer, v. 15, p. 1-11 art. 660, 2015Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1186/s12885-015-1666-2. Acesso em: 05 maio 2024.
APA
Gomes, L. R., Fujita, A., Mott, J. D., Soares, F. A., Labriola, L., & Sogayar, M. C. (2015). RECK is not an independent prognostic marker for breast cancer. BMC Cancer, 15, 1-11 art. 660. doi:10.1186/s12885-015-1666-2
NLM
Gomes LR, Fujita A, Mott JD, Soares FA, Labriola L, Sogayar MC. RECK is not an independent prognostic marker for breast cancer [Internet]. BMC Cancer. 2015 ; 15 1-11 art. 660.[citado 2024 maio 05 ] Available from: https://doi.org/10.1186/s12885-015-1666-2
Vancouver
Gomes LR, Fujita A, Mott JD, Soares FA, Labriola L, Sogayar MC. RECK is not an independent prognostic marker for breast cancer [Internet]. BMC Cancer. 2015 ; 15 1-11 art. 660.[citado 2024 maio 05 ] Available from: https://doi.org/10.1186/s12885-015-1666-2
Parte de monografia/livro
Interdisciplinaridade em ação na pesquisa e pós-graduação em Bioinformática (2015)
Durham, Alan Mitchell ; Setubal, João Carlos ; Barrera, Júnior
Fonte: Práticas da interdisciplinaridade no ensino e pesquisa. Unidades: IME, IQ
Assuntos: BIOINFORMÁTICA, INTERDISCIPLINARIDADE
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
DURHAM, Alan Mitchell e SETUBAL, João Carlos e BARRERA, Júnior. Interdisciplinaridade em ação na pesquisa e pós-graduação em Bioinformática. Práticas da interdisciplinaridade no ensino e pesquisa. Tradução . Barueri: Manole, 2015. . . Acesso em: 05 maio 2024.
APA
Durham, A. M., Setubal, J. C., & Barrera, J. (2015). Interdisciplinaridade em ação na pesquisa e pós-graduação em Bioinformática. In Práticas da interdisciplinaridade no ensino e pesquisa. Barueri: Manole.
NLM
Durham AM, Setubal JC, Barrera J. Interdisciplinaridade em ação na pesquisa e pós-graduação em Bioinformática. In: Práticas da interdisciplinaridade no ensino e pesquisa. Barueri: Manole; 2015. [citado 2024 maio 05 ]
Vancouver
Durham AM, Setubal JC, Barrera J. Interdisciplinaridade em ação na pesquisa e pós-graduação em Bioinformática. In: Práticas da interdisciplinaridade no ensino e pesquisa. Barueri: Manole; 2015. [citado 2024 maio 05 ]
Artigo de periodico
Non-coding transcription characterization and annotation (2012)
Paschoal, Alexandre Rossi; Maracajá-Coutinho, Vinicius Ramos Henriques; Setubal, João Carlos ; Simões, Zila Luz Paulino; Verjovski-Almeida, Sergio ; Durham, Alan Mitchell
Fonte: RNA Biology. Unidades: IQ, FFCLRP, IME
Assuntos: BIOINFORMÁTICA, RNA
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
PASCHOAL, Alexandre Rossi et al. Non-coding transcription characterization and annotation. RNA Biology, v. 9, n. 3, p. 274-282 : + Supplementary materials ( S1-S92), 2012Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.4161/rna.19352. Acesso em: 05 maio 2024.
APA
Paschoal, A. R., Maracajá-Coutinho, V. R. H., Setubal, J. C., Simões, Z. L. P., Verjovski-Almeida, S., & Durham, A. M. (2012). Non-coding transcription characterization and annotation. RNA Biology, 9( 3), 274-282 : + Supplementary materials ( S1-S92). doi:10.4161/rna.19352
NLM
Paschoal AR, Maracajá-Coutinho VRH, Setubal JC, Simões ZLP, Verjovski-Almeida S, Durham AM. Non-coding transcription characterization and annotation [Internet]. RNA Biology. 2012 ; 9( 3): 274-282 : + Supplementary materials ( S1-S92).[citado 2024 maio 05 ] Available from: https://doi.org/10.4161/rna.19352
Vancouver
Paschoal AR, Maracajá-Coutinho VRH, Setubal JC, Simões ZLP, Verjovski-Almeida S, Durham AM. Non-coding transcription characterization and annotation [Internet]. RNA Biology. 2012 ; 9( 3): 274-282 : + Supplementary materials ( S1-S92).[citado 2024 maio 05 ] Available from: https://doi.org/10.4161/rna.19352
Artigo de periodico
The sugarcane genome challenge: strategies for sequencing a highly complex genome (2011)
Souza, Gláucia Mendes ; Berges, Helene; Bocs, Stephanie; Casu, Rosanne; D'Hont, Angelique; Ferreira, João Eduardo ; Henry, Robert; Ming, Ray; Potier, Bernard; Van Sluys, Marie-Anne ; Vincentz, Michel; Paterson, Andrew H
Fonte: Tropical Plant Biology. Unidades: IQ, IME, IB
Assuntos: ALIMENTOS TRANSGÊNICOS, CANA-DE-AÇÚCAR, GENOMAS
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
SOUZA, Gláucia Mendes et al. The sugarcane genome challenge: strategies for sequencing a highly complex genome. Tropical Plant Biology, 2011Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1007/s12042-011-9079-0. Acesso em: 05 maio 2024.
APA
Souza, G. M., Berges, H., Bocs, S., Casu, R., D'Hont, A., Ferreira, J. E., et al. (2011). The sugarcane genome challenge: strategies for sequencing a highly complex genome. Tropical Plant Biology. doi:10.1007/s12042-011-9079-0
NLM
Souza GM, Berges H, Bocs S, Casu R, D'Hont A, Ferreira JE, Henry R, Ming R, Potier B, Van Sluys M-A, Vincentz M, Paterson AH. The sugarcane genome challenge: strategies for sequencing a highly complex genome [Internet]. Tropical Plant Biology. 2011 ;[citado 2024 maio 05 ] Available from: https://doi.org/10.1007/s12042-011-9079-0
Vancouver
Souza GM, Berges H, Bocs S, Casu R, D'Hont A, Ferreira JE, Henry R, Ming R, Potier B, Van Sluys M-A, Vincentz M, Paterson AH. The sugarcane genome challenge: strategies for sequencing a highly complex genome [Internet]. Tropical Plant Biology. 2011 ;[citado 2024 maio 05 ] Available from: https://doi.org/10.1007/s12042-011-9079-0
Artigo de periodico
Inferring contagion in regulatory networks (2011)
Fujita, André ; Sato, João Ricardo ; Demasi, Marcos Angelo Almeida ; Yamaguchi, Rui ; Shimamura, Teppei ; Ferreira, Carlos Eduardo ; Sogayar, Mari Cleide ; Miyano, Satoru
Fonte: IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics. Unidades: IME, IQ
Assuntos: REGULAÇÃO GÊNICA, BIOQUÍMICA
A citação é gerada automaticamente e pode não estar totalmente de acordo com as normas
ABNT
FUJITA, André et al. Inferring contagion in regulatory networks. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, v. 8, n. 2, p. 570-576, 2011Tradução . . Disponível em: https://doi.org/10.1109/tcbb.2010.40. Acesso em: 05 maio 2024.
APA
Fujita, A., Sato, J. R., Demasi, M. A. A., Yamaguchi, R., Shimamura, T., Ferreira, C. E., et al. (2011). Inferring contagion in regulatory networks. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 8( 2), 570-576. doi:10.1109/tcbb.2010.40
NLM
Fujita A, Sato JR, Demasi MAA, Yamaguchi R, Shimamura T, Ferreira CE, Sogayar MC, Miyano S. Inferring contagion in regulatory networks [Internet]. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics. 2011 ; 8( 2): 570-576.[citado 2024 maio 05 ] Available from: https://doi.org/10.1109/tcbb.2010.40
Vancouver
Fujita A, Sato JR, Demasi MAA, Yamaguchi R, Shimamura T, Ferreira CE, Sogayar MC, Miyano S. Inferring contagion in regulatory networks [Internet]. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics. 2011 ; 8( 2): 570-576.[citado 2024 maio 05 ] Available from: https://doi.org/10.1109/tcbb.2010.40

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